Object

Title: Modelowanie molekularne receptora dopaminergicznego typu D1 w oparciu o oddziaływania ze związkami o aktywności psychotropowej

Abstract:

Rozprawa przedstawia zagadnienia związane z zastosowaniem i rozwojem metody budowy modeli homologicznych receptorów sprzężonych z białkiem G oraz ich wykorzystaniem w wirtualnym skriningu. Przyjęta metoda polega na optymalizacji miejsca wiążącego, przy pomocy struktury liganda danego receptora. Badania zostały zrealizowane na przykładzie receptora dopaminowego typu D1, będącego reprezentantem układów biologicznych o istotnym znaczeniu farmakologicznym. Potwierdzono skuteczność zastosowanej metody w budowie modeli poprawnie przewidujących oddziaływania ligand-receptor, przeprowadzając ocenę wpływu kluczowych jej elementów na rezultat modelowej, retrospektywnej próby wirtualnego skriningu. Wykazano przewagę zdolności predykcyjnych w wirtualnym skriningu nowo otrzymanych modeli nad referencyjnymi, zbudowanymi w oparciu o wcześniej stosowaną metodę. Podejście to okazało się również skuteczniejsze od metody przewidywania powinowactwa, opartej na właściwościach cząsteczek. Dowiedziono, że opracowane modele prawidłowo opisują powinowactwo związków (zwłaszcza agonistów), odległych strukturalnie od ligandów użytych w procesie ich optymalizacji. Ustalono, iż kluczowe dla jakości modeli jest zastosowanie, na etapie optymalizacji, zestawu ligandów o zróżnicowanej strukturze, jak również skutecznej metody wyboru najlepszych modeli. Dokonano analizy budowy miejsca wiążącego receptora D1 oraz sposobu wiązania jego ligandów, w kontekście selektywności względem receptora D2. Wykonano także prospektywny wirtualny skrining własnej biblioteki związków chemicznych, identyfikując nowy chemotyp ligandów receptora D1 o wysokim powinowactwie, potwierdzonym w badaniach in vitro.

Place of publishing:

Kraków

Level of degree:

2 - studia doktoranckie

Degree discipline:

farmacja

Degree grantor:

Uniwersytet Jagielloński. Collegium Medicum. Wydział Farmaceutyczny. Katedra Chemii Farmaceutycznej. Zakład Chemii Leków.

Promoter:

Maciej Pawłowski

Date issued:

2014

Format:

application/pdf

Identifier:

oai:dl.cm-uj.krakow.pl:3926

Call number:

ZB-121442

ControlNumberVIRTUA:

click here to follow the link

Access rights:

nieograniczony

Location of original object:

Biblioteka Medyczna Uniwersytetu Jagiellońskiego- Collegium Medicum

Object collections:

Last modified:

Jun 26, 2019

In our library since:

Nov 26, 2014

Number of object content hits:

532

Number of object content views in PDF format

533

All available object's versions:

http://dl.cm-uj.krakow.pl:8080/publication/3926

Show description in RDF format:

RDF

Show description in OAI-PMH format:

OAI-PMH

Edition name Date
ZB-121442 Jun 26, 2019
×

Citation

Citation style:

This page uses 'cookies'. More information