Praca doktorska składa się z trzech głównych części. W pierwszej opisano analizę konformacyjną szerokiej grupy złożonych arylopiperazyn z uwzględnieniem wpływu środowiska wodnego, połączoną z analizą i podsumowaniem wszystkich dostępnych danych na temat konformacji długołańcuchowych arylopiperazyn, uzyskanych metodami rentgenograficznymi i spektroskopii NMR. Wynikiem analiz jest ustalenie najbardziej prawdopodobnej, niskoenergetycznej konformacji tych związków, trwałej w roztworze, która może (jakkolwiek nie musi) być tożsama z konformacją bioaktywną w receptorze. Druga część pracy obejmuje modelowanie oddziaływań z receptorem 5-HT]A, labilnych konformacyjnie pochodnych arylopiperazynowych, zawierających łącznik butylowy i 2-butenylowy (ustalenie sposobu wiązania liganda w receptorze) oraz walidację modelu w eksperymentach przewidywania powinowactwa. W badaniach zastosowano procedurę automatycznego dokowania ligandów do wielokonformacyjnej populacji modeli receptora, odzwierciedlającej fleksyjność ligandów i receptora. Część trzecia dotyczy modelowania receptora 5-HT7, W aspekcie oddziaływań z różnymi klasami jego antagonistów. Ze względu na podobieństwa pomiędzy receptorami 5-HT)A i 5-HT7, modelowanie receptora 5-HT7 oparte zostało na danych i doświadczeniach uzyskanych podczas modelowania receptora 5-HT]A. Informacje na temat zależności struktura- powinowactwo i struktura ; -selektywność zostały zawarte w nowym modelu farmakoforowym dla antagonistów receptora 5-HT7, opartym na analizie oddziaływań ligandów z modelem białka receptorowego.
Mar 7, 2023
Nov 21, 2012
31
0
http://dl.cm-uj.krakow.pl:8080/publication/1148
Edition name | Date |
---|---|
ZB-105982 | Mar 7, 2023 |
Kołaczkowski, Marcin
Sudoł-Tałaj, Sylwia
Yuzlenko, Olga
Żmudzki, Paweł
Gawalska, Alicja
Żuchowski, Grzegorz
Łapińska, Natalia
Głuch-Lutwin, Monika