Search for: [Abstract = "ur krystalicznych CBR1 i AKR1C3, a następnie wykorzystania ich w poszukiwaniu nowych inhibitorów enzymatycznych. W pierwszej części badań, mającej na celu poszukiwanie nowych inhibitorów CBR1, przeprowadzono optymalizację dwóch struktur krystalicznych enzymu \(kody PDB\: 1WMA i 3BHJ\), różniących się obecnością cząsteczki glutationu w centrum aktywnym CBR1. Wykorzystując metody optymalizacji \(Induced\-fit docking, dokowanie, dynamika molekularna\) i oceny \(retrospektywny wirtualny skrining\) trójwymiarowych modeli celów biologicznych, wybrano 2 modele \(1WMA_A3 oraz 3BHJ_N1\), przy użyciu których przeprowadzono następnie prospektywny wirtualny skrining, dokując bibliotekę ponad 2,3 miliona związków chemicznych. Wytypowano, zakupiono, a następnie sprawdzono w badaniach hamowania CBR1 9 nowych chemotypów potencjalnych inhibitorów. Wśród nich najskuteczniejszym okazał się związek będący pochodną 2\-fenylo\-3,4\-dihydrochinazolin\-4\-onu \(związek C2, IC50 = 7,56 μM\). W wyniku dalszych optymalizacji strukturalnych uzyskano kolejne inhibitory, a najskuteczniejszym z nich okazał się związek C17 \(IC50 = 0,68 μM\). W pozach uzyskanych w dokowaniach nawiązywał on oddziaływania z wszystkimi kluczowymi resztami aminokwasowymi enzymu\: Ser139, Tyr193, Met234 \(wiązania wodorowe\) i Trp229 \(oddziaływanie hydrofobowe typu π\-π\). W drugiej części badań przeanalizowano możliwość ham"]

Number of results: 1