Search for: [Abstract = "oraz 14 chorych z gruczolakiem pęcherzykowym \(FA\) tarczycy. Obie grupy porównano pod kątem struktury płci, wieku, obecności choroby Hashimoto, średnicy guza oraz ultrasonograficznych czynników ryzyka jako punktacji w skali EU\-TIRADS. Fragmenty guza oraz niezmienioną makroskopowo tkankę tarczycy zostały pobrane przez doświadczonego patologa, które zabezpieczono w RNA Later, a następnie umieszczono w temperature 80 st. C do momentu ekstrakcji RNA. Krew pobrano w sali operacyjnej przed nacięciem skóry. Około 50\-100mg tkanki guza poddano lizie przy użyciu preaparatu TissueLyser LT \(Qiagen, Hilden, Germany\) i pobrano RNA. Z 0,5ml osocza wyizolowano całkowite RNA według protokołu RNAzol. Tak zwane małe RNA \( small RNA\) zastosowano do przygotowania bibliotek NGS. W celu uzyskania RNA o wysokiej jakości usunięto z dalszej analizy odczyty zawierające poniżej 15 nukleotydów oraz nieposiadające adapterów. Po przygotowaniu bibliotek przeprowadzono sekwencjonowanie nowej generacji w aparacie NextSeq \(llumina, San Diego, CA, USA\). Uzyskane wyniki znormalizowano dostosowując je do rozmiarów bibliotek i przedstawiono jako liczbę odczytów na milion \(CPM\) wykorzystując oprogramowanie miRDeep2 software. Otrzymane odczyty miRNA zostały zachowane na lokalnym serwerze. Poddano ocenie jakość odczytów za pomocą oprogramowanie FastQC software. Tak opracowane znormalizowane wyniki – CPM"]
