Search for: [Abstract = "ązania jego najaktywniejszego inhibitora, który zaproponowano opierając się na dostępnych danych literaturowych. Model PDE4B opracowany na bazie dostępnych struktur krystalicznych, również uwidaczniał sposób wiązania selektywnego liganda, który charakteryzował się najwyższą aktywnością hamującą enzym. Do przygotowania jak i zweryfikowania wszystkich modeli strukturalnych wykorzystano optymalizację modelu białka, dokowanie inhibitorów referencyjnych na drodze tzw. indukowanego dopasowania, retrospektywny wirtualny skrining oraz symulacje dynamiki molekularnej, których analiza przyczyniła się do wygenerowania specyficznych modeli farmakoforowych tzw. dynoforów \(ang. dynophores\). Opracowane modele farmakoforowe jak i modele strukturalne wykorzystano do przeprowadzenia dwuetapowego procesu wirtualnego skriningu 4 126 936 ligandów\: dopasowania do hipotez farmakoforowych oraz dokowania wyselekcjonowanych w pierwszym etapie grup ligandów. Badania prowadzone w ramach podejścia opartego na ligandach polegały na opracowaniu regresyjnych modeli empirycznych wykorzystujących uczenie maszynowe, które miały na celu predykcję wartości aktywności hamującej pIC50 na podstawie deskryptorów molekularnych opisujących struktury znanych ligandów celów biologicznych. W procesie wirtualnego skriningu ich zastosowanie pozwoli na wyselekcjonowanie potencjalnie skutecznych inhibitorów oraz dostarczy inf"]
